ሾጣጣዎች ወደ ስካፎልዶች እንዴት ይሰበሰባሉ?

2024 ደራሲ ደራሲ: Miles Stephen | [email protected]. ለመጨረሻ ጊዜ የተሻሻለው: 2023-12-15 23:33

ረቂቅ ጂኖም በሚፈጥሩበት ጊዜ የዲኤንኤ ንባብ በግለሰብ ደረጃ መጀመሪያ ነው። ወደ contigs ተሰብስበው , ይህም በባህሪያቸው ስብሰባ , በመካከላቸው ክፍተቶች አሉባቸው. ቀጣዩ እርምጃ ነው። ወደ ከዚያም በእነዚህ መካከል ያሉትን ክፍተቶች ድልድይ ወደ መፍጠር ሀ ስካፎልድ . ይህ በኦፕቲካል ካርታ ወይም ተጓዳኝ-ጥንድ ቅደም ተከተል በመጠቀም ሊከናወን ይችላል።

በተመሳሳይ, እርስዎ ሊጠይቁ ይችላሉ, ኮንቲግ እና ስካፎልዶች ምንድን ናቸው?

ሀ ስካፎልድ ከመጨረሻ ተከታታይ ሙሉ-ጂኖም የተኩስ ሽጉጥ ክሎኖች እንደገና የተገነባው የጂኖም ቅደም ተከተል ክፍል ነው። ስካፎልድስ የተውጣጡ ናቸው። contigs እና ክፍተቶች. ሀ ኮንግ የመሠረቶቹ ቅደም ተከተል በከፍተኛ የመተማመን ደረጃ የሚታወቅበት ተከታታይ የጂኖሚክ ቅደም ተከተል ርዝመት ነው። በአንዳንድ ሁኔታዎች, ስካፎልድስ መደራረብ ይችላል።

እንዲሁም፣ በባዮኢንፎርማቲክስ ውስጥ ኮንቲግ ምንድን ነው? ሀ ኮንግ (ከcontiguous) የዲኤንኤ የጋራ ስምምነት ክልልን የሚወክሉ ተደራራቢ የዲኤንኤ ክፍሎች ስብስብ ነው። Contigs ስለዚህ ሁለቱንም ወደ ተደራረቡ የዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች እና እንደ አውድ ሁኔታ በክሎኖች ውስጥ የሚገኙትን ተደራቢ አካላዊ ክፍሎችን (ቁርጥራጮችን) ሊያመለክት ይችላል።

በዚህ ረገድ ኮንጊዎች እንዴት ይሰበሰባሉ?

የተደራረቡ የዲኤንኤ ቅደም ተከተል የዲኤንኤ ቁርጥራጮች ስብስብ በመባል ይታወቃል ኮንግ . ቀጥል ካርታ ስራ ተደራቢ ክሎኖች ያሉት ሂደት ነው። ተሰብስበው ያንን መደራረብ ለመከተል. ይህ ማደራጀትን ያካትታል contigs በቅደም ተከተል እና አቀማመጥ. ክሎን። contigs በራስ-ሰር ሊሆን ይችላል ተሰብስበው የ BAC-መጨረሻ ቅደም ተከተላቸውን በመጠቀም።

ለምንድነው ኮንቲግ ጠቃሚ የሆኑት?

ቀጥል ስብሰባ ነው። አስፈላጊ በጂኖም ስብሰባ ውስጥ ደረጃ. ለካርታ ስራ፣ ተደራራቢ ክሎኖች በተደራረቡበት ቅደም ተከተል ይሰበሰባሉ። እያንዳንዱ ቁርጥራጭ በቬክተር ውስጥ ተዘግቶ ከሁለቱም ጫፎች በቅደም ተከተል ተቀምጧል ከ600-700 ቢ.ፒ. ከሁለቱም የዲ ኤን ኤ ቁራጭ ጫፎች ቅደም ተከተል ጥንድ ጫፍ ይባላል.