የአሰላለፍ ነጥብ እንዴት ይሰላል?

2024 ደራሲ ደራሲ: Miles Stephen | [email protected]. ለመጨረሻ ጊዜ የተሻሻለው: 2023-12-15 23:33

የ ነጥብ የ አሰላለፍ , ኤስ, የተሰላ እንደ የመተካት እና ክፍተት ድምር ውጤቶች . ምትክ ውጤቶች በፍለጋ ሰንጠረዥ ይሰጣሉ (PAM፣ BLOSUM ይመልከቱ)። ክፍተት ውጤቶች በተለምዶ የተሰላ እንደ G ድምር፣ ክፍተቱ መክፈቻ ቅጣት እና ኤል፣ ክፍተት ማራዘሚያ ቅጣት። ለ ርዝመት n ክፍተት፣ ክፍተቱ ዋጋ G+Ln ይሆናል።

በዚህ መሠረት፣ የአሰላለፍ ነጥብ ምንድን ነው?

ምርጥ አሰላለፍ እና የአሰላለፍ ውጤት በጣም ጥሩ አሰላለፍ ነው አሰላለፍ ከፍተኛውን መስጠት ነጥብ , እና የአሰላለፍ ውጤት ይህ ከፍተኛ ነው ነጥብ . ማለትም፣ የ የአሰላለፍ ውጤት የ X እና Y = የ ነጥብ የ X እና Y በጥሩ ሁኔታ አሰላለፍ . ለምሳሌ ፣ የ የአሰላለፍ ውጤት ከሚከተሉት X እና Y ውስጥ 36 ናቸው።

ከላይ በተጨማሪ፣ ተከታታይ አሰላለፍ እንዴት ነው የሚሰራው? በባዮኢንፎርማቲክስ፣ አ ቅደም ተከተል አሰላለፍ የሚለውን የማደራጀት መንገድ ነው። ቅደም ተከተሎች በዲ ኤን ኤ ፣ አር ኤን ኤ ወይም ፕሮቲን መካከል በተግባራዊ ፣ መዋቅራዊ ወይም በዝግመተ ለውጥ ግንኙነቶች ምክንያት ተመሳሳይነት ያላቸውን ክልሎች ለመለየት ቅደም ተከተሎች.

ከዚህ ውስጥ፣ በባዮኢንፎርማቲክስ ነጥብ ምንድን ነው?

በቅደም ተከተል አሰላለፍ አውድ ሀ ነጥብ የአሰላለፍ አጠቃላይ ጥራትን የሚገልጽ የቁጥር እሴት ነው። ከፍተኛ ቁጥሮች ከከፍተኛ ተመሳሳይነት ጋር ይዛመዳሉ። የ ነጥብ ልኬቱ የሚወሰነው በ ማስቆጠር ጥቅም ላይ የዋለ ስርዓት (የመተካት ማትሪክስ, ክፍተት ቅጣት).

በቅደም ተከተል አሰላለፍ ውስጥ ጥሩ አሰላለፍ ምንድነው?

የ ምርጥ አሰላለፍ ከሁለት ፕሮቲን ቅደም ተከተሎች ን ው አሰላለፍ ጥንድ-ነጥብ ድምርን ከፍ ያደርገዋል ለተዋወቁ ክፍተቶች ከማንኛውም ቅጣት ያነሰ። ተለዋዋጭ ፕሮግራሞችን ይፈቅዳል ምርጥ አሰላለፍ የሁለት ቅደም ተከተሎች በ mnsteps ቅደም ተከተል ውስጥ ለመገኘት, m እና n የርዝመቶች ርዝመት ናቸው ቅደም ተከተሎች.